Project
平成26年度研究計画
プロジェクトの後半では，長鎖RNAの機能構造領域の解析を引き続き進めるとともに，発見した機能構造領域に対するRNAアプタマーを開発し，機能の検証およびその応用を試みる．構造領域の解析手法に関しては，シュードノットやキッシングループなど，二次構造の範疇を超えたRNA構造も含めた解析を行うことに挑戦する．すでにvsfoldの最新版であるvsfold5には，シュードノットを予測する機能が付加されており，これを応用することを計画している．
アプタマーは，ある特定の分子に対して特異的に結合する核酸分子のことで，SELEX法と呼ばれる手法により取得することが可能である．プロジェクトにおいて見出した機能構造領域について，RNAアプタマーを取得することを試みる．取得したアプタマーと長鎖RNAとの相互作用を解析するとともに，アプタマーによる機能阻害等の検討も行う．さらに，長鎖RNAとアプタマーの組合せを応用し，例えば，基板上に細胞を整列させるツールとして利用することなど，生体工学的な展開も視野に入れている．