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平成24年度研究計画
平成24年度は，長鎖RNAにおいて構造を形成する領域（構造領域）を推定する手法の開発を引き続き進め，構造領域の推定方法の効率化を図る．また，これと並行して，mRNA，lncRNAあるいはウイルスRNAに適用し，構造領域の推定を試みる．mRNAについては，免疫系細胞や神経細胞などにおいて特異的に発現しているmRNAを選定し，GenoPoemicsおよびvsfoldによる解析を試みる．さらに，得られた構造領域候補についてはNMR法による解析も進める．lncについては，染色体の遺伝子発現量の補正に関与するXist RNAやゲノムインプリンティングに関与するRNAなどについて，同様な解析を試みる．ウイルスゲノムRNAについては，HIV-1の5'-UTRに存在する二量体化開始部位などの構造領域，HCVのIRES，あるいは植物ウイルスのゲノムRNAに含まれるtRNA様構造（TLS）などについて，同様な解析を行い，手法の評価を行うとともに，新しい構造領域の発見を試みる．
一方，構造領域が見出された場合には，その機能解析として，相互作用する可能性のあるタンパク質因子の探索，および相互作用の解析を試みる．