論文（査読あり）（67件）
1) R.Sudo, Y.Inamori, K.Murakami, M.Okada, H.Ohtake：Effect of Micro Animals on Prosperity and Decay of Plasmid DNA Transconjugant, Preprint of Poster Papers on Water Pollution Research and Control, Kyoto, pp.331-334 (1990.7.)
2) Y.Inamori, K.Murakami, R.Sudo, Y.Kurihara, N.Tanaka：Environmental Assessment Method for Field Release of Genetically Engineered Microorganisms Using Microcosm Systems, Water Science and Technology, Vol.26, No.9-11, pp.2161-2164 (1992.5.)
3) K.Murakami, Y.Inamori, R.Sudo, Y.Kurihara：Effect of Temperature on Prosperity and Decay of Genetically Engineered Microorganisms in a Microcosm System, Water Science and Technology, Vol.26, No.9-11, pp.2165-2168 (1992.5.)
4) 村上和仁、稲森悠平、林 紀男、須藤隆一：微小動物の増殖に及ぼす微生物農薬の影響、日本水処理生物学会誌、29巻、1号、pp.31-38 (1993.7.)
5) 稲森悠平、村上和仁、角田美奈子、佐藤瑠佳、栗原 康：遺伝子組換え細菌と親株細菌の相互作用に関する研究、日本水処理生物学会誌、29巻、1号、pp.39-49 (1993.7.)
6) N.Tanaka, Y.Inamori, K.Murakami, T.Akamatsu, Y.Kurihara：Effect of Species Composition on Stability and reproductivity of Small-scale Microcosm System, Water Science and Technology, Vol.30, No.10, pp.125-131 (1994.6.)
8) Y.Inamori, K.Murakami, R.Sato, N.Tanaka, R.Sudo, Y.Kurihara：Interactions between GEMs and Indigenous microorganisms in Aquatic Ecosystem, Water Science and Technology, Vol.34, No.7-8, pp.397-405 (1996.6.)
9) 駒井幸雄、古武家善成、清木 徹、永淵 修、村上和仁、小山武信、蠣灰谷喬：瀬戸内海における底質中重金属濃度の分布と変化、水環境学会誌、21巻、11号、pp.743-750 (1998.11.)
10) 村上和仁、今富幸也、駒井幸雄、永淵 修、清木 徹、小山武信：瀬戸内海における環形動物（Annelida）の生息状況と底質環境の関係、水環境学会誌、21巻、11号、pp.757-764 (1998.11.)
11) 清木 徹、駒井幸雄、小山武信、永淵 修、日野康良、村上和仁：瀬戸内海における汚濁負荷量と水質の変遷、水環境学会誌、21巻、11号、pp.780-788 (1998.11.)
12) 永淵 修、東 義仁、清木 徹、駒井幸雄、村上和仁、小山武信：最近10年間における瀬戸内海底質の変動評価、水環境学会誌、21巻、11号、pp.797-804 (1998.11.)
13) 村上和仁、鷹野 洋、吉岡敏行、荻野泰夫、森 忠繁：児島湖における植物プランクトンの種構成と季節的消長、水環境学会誌、22巻、9号、pp.770-775 (1999.9.)
14) K.Murakami, H.Takano, Y.Katayama, Y.Ogino, T.Mori, O.Nagafuchi, Y.Komai, T.Seiki：Relationship between Macrobenthic Fauna and Sedimental Condition in the Seto Inland Sea, Proceedings of MEDCOAST99-EMECS99 Joint Conference, Vol.1, pp.111-122 (1999.11.)
15) Y.Komai, A.Hoshika, Y.Kobuke, T.Seiki, O.Nagafuchi, K.Murakami, T.Koyama, T.Kakibaya：Horizontal and Vertical Distribution of Heavy Metals in the Sediment of the Seto Inland Sea, Proceedings of MEDCOAST99-EMECS99 Joint Conference, Vol.1, pp.477-487 (1999.11.)
16) O.Nagafuchi, Y.Imatomi, T.Seiki, K.Murakami, Y.Komai：Typical Change of Sediment at the Sea of Hibiki, the Seto Inland Sea during Last 10 Years, Proceedings of MEDCOAST99-EMECS99 Joint Conference, Vol.1, pp.509-520 (1999.11.)
17) K.Murakami, H.Matsushima, K.Tanaka, T.Ishii, K.Taki：Inspection of Magnesium Treatment Effect on Nutrient Elution from Eutrophicated Lake Sediment, Proceedings of 1st World Water Congress of the International Water Association (Paris 2000), CD-ROM (2000.7.)
18) K.Taki, K.Murakami, H.Matsushima, S.Mononobe, K.Kato：Characteristics on Spring Hybrid Filter applied to Waste Water Treatment, Proceedings of 1st World Water Congress of the International Water Association (Paris 2000), CD-ROM (2000.7.)
19) T.Muto, T.Saito, H.Matsushima, K.Tanaka, K.Murakami, K.Taki：NO2-N Accumulation through Denitrification Reaction with Lake Sediment, Proceedings of 2nd IWA International Symposium on Sequencing Batch Reacter Technology (SBRT-2), pp.161ｰ164 (2000.7.)
20) K.Murakami, X.Hu, M.Han, H.Matsushima, T.Ishii, K.Taki：Fundamental Study for Bioremediation in Eutrophicated Water Bodies; Estimation of Sedimental Treatment Efficiency by Phytoplanktonic Flora, Proceedings of 5th International Symposium on Environmental Biotechnology (ISEB2000), CD-ROM, pp.601-604 (2000.7.)
21) X.Hu, M.Han, K.Murakami, K.Taki：Fundamental Study for Bioremediation in Eutrophicated Water Bodies; Coagulation Mechanism on Harmful Plankton for Water Quality, Proceedings of 5th International Symposium on Environmental Biotechnology (ISEB2000), CD-ROM, pp.605-608 (2000.7.)
22) M.Han, W.Kim, K.Murakami, K.Taki, X.Hu：Fundamental Study for Bioremediation in Eutrophicated Water Bodies; Coagulation Mechanisms in Several On-Site Algae Removal Methods, Proceedings of 5th International Symposium on Environmental Biotechnology (ISEB2000), CD-ROM, pp.609-612 (2000.7.)
23) 村上和仁、石井裕一、瀧 和夫、長谷川昭仁：東京湾奥部に位置する潟湖化干潟の遷移特性、土木学会海岸工学論文集、47巻、pp.1121-1125 (2000.11.)
24) 石井裕一、村上和仁、瀧 和夫：主要環境構成因子による干潟の分類と谷津干潟の変遷、環境情報科学論文集、14巻、pp.213-218 (2000.11.)
25) T.Mishina, K.Murakami, K.Taki：Cyclic Local Erosion Formed by Multiphase Flow in Alluvial Fan, Proceedings of 4th International Conference on Multiphase Flow (ICMF2001), CD-ROM (2001.5.)
26) 石井裕一、村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫：埋立てから取り残された自然干潟の生態系バランスと環境構成因子、土木学会海洋開発論文集、17巻、pp.129-134 (2001.6.)
27) Y.Amano, K.Murakami, T.Ishii, K.Taki, H.Matsushima：Elution of Nutrient Salts from Sediment Layer in Eutrophicated Lake, Proceedings of 1st IWA Asia-Pacific Regional Conference (Asian Waterqual 2001), Vol.2, pp.193-198 (2001.9.)
28) K.Murakami, Y.Amano, K.Taki, H.Matsushima：Simulation of Water Quality in Eutrophicated Lake with Mathematical Ecosystem Model, Proceedings of 1st IWA Asia-Pacific Regional Conference (Asian Waterqual 2001), Vol.2, pp.363-367 (2001.9.)
29) K.Murakami, Y.Amano, X.Hu, H.Matsushima, T.Ishii, K.Taki：Ecological Estimation on Effect of On-Site Purification on Eutrophicated Lake, Proceedings of 2nd World Water Congress of the International Water Association (Berlin 2001), CD-ROM (2001.10.)
30) A.Higashiyama, K.Murakami, K.Taki, H.Tatsumoto, S.Mononobe, K.Kato：Removal Characteristics of Spring Hybrid Filter applied to Water Bloom Treatment, Proceedings of 2nd World Water Congress of the International Water Association (Berlin 2001), CD-ROM (2001.10.)
31) K.Murakami, Y.Ishii, Y.Tanaka, K.Taki, H.Tatsumoto：Seasonal Change of Macrobenthic Fauna in Enclosed Tidal Flat of Tokyo Inner Bay, Proceedings of 5th International Conference on the Mediterranean Coastal Environment (MEDCOAST 01), Vol.2, pp.629-640 (2001.10.)
32) T.Hoshino, T.Saito, H.Matsushima, K.Murakami, K.Taki, I.Nakajima：Filtering Property of a Bivalve of "Mashijimi" for Removing Suspending Organic Solids in Eutrophicated Lakes, Proceedings of 9th International Conference on the Conservation and Management of Lakes (ILEC 2001), pp.228-231 (2001.11.)
33) 石井裕一、村上和仁、矢内栄二、石井俊夫、瀧 和夫：東京湾奥部に位置する潟湖化干潟におけるアオサの栄養塩類吸収特性、土木学会海岸工学論文集、48巻、pp.1136-1140 (2001.11.)
34) 石井裕一、村上和仁、瀧 和夫、立本英機：生物種間相互作用に着目した東京湾奥干潟のマイクロコズム物質循環実験、環境情報科学論文集、15巻、pp.273-278（2001.11.）
35) 天野佳正、村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、立本英機、本田善則：湖沼の堆積有機物がもつ生体有機物エネルギーからみた水質浄化、環境情報科学論文集、15巻、pp.279-284（2001.11.）
36) 村上和仁、天野佳正、瀧 和夫、松島 眸：生態系エコサイクルの適正化に基づく富栄養化湖沼の直接浄化、環境情報科学論文集、15巻、pp.285-290 (2001.11.)
37) Y.Ishii, K.Murakami, K.Taki, H.Tatsumoto：Histrical Succession for Water Environment on the Tidal Flat located in Urban Coastal Zone, Proceedings of International Conference on Engineering for Ocean & Offshore Structures (OOS2001) and Coastal Engineering Development (CED2001), pp.62-69 (2001.12.)
38) Y.Ishii, K.Murakami, K.Taki, H.Tatsumoto：Water Quality Purification depend on Macrophyte in Tidal Flat located in Urban Coastal Zone, Conference Papers on 5th International IWA Conference on Waste Stabilisation Ponds, Vol.2, pp.741-746 (2002.4.)
39) K.Murakami, S.Narawa, T.Ishii, K.Taki, H.Matsushima：Ecocycle Management for On-Site Purification of Eutrophicated Lakes, Proceedings of 3rd IWA World Water Congress of the International Water Association (Melbourne 2002), CD-ROM (2002.4.)
40) Y.Ishii, K.Murakami, K.Taki, H.Tatsumoto：Effect of Environmental Factors on Ecological Balance of Natural Tidal Flat left from Reclamation, Proceedings of 3rd IWA World Water Congress of the International Water Association (Melbourne 2002), CD-ROM (2002.4.)
41) Y.Amano, K.Taki, K.Murakami, T.Ishii, H.Matsushima：Sediment Remediation for Ecosystem in Eutrophicated Lakes, The Scientific World, Vol.2, pp.885-891 (2002.4.)
42) 石井裕一、村上和仁、瀧 和夫、立本英機：干潟における物質循環に及ぼす生物種間相互作用、土木学会海洋開発論文集、18巻、pp.557-562 (2002.6.)
43) 石井裕一、立本英機、村上和仁、矢内栄二、瀧 和夫：高密度都市域における潟湖化干潟の生態工学的特性、土木学会海岸工学論文集、49巻、pp.1291-1295 (2002.10.）
44) K.Taki, Y.Ishii, H.Tatsumoto, M.Machida. K.Murakami：Nutrient Mass Balance in a Lagoon-type Tidal Flat left from Reclamation Works in Urban Coastal Zone, Proceedings of 2nd Korea-Japan Joint Workshop on Tidal Flat, CD-ROM (2002.11.)
45) 村上和仁、天野佳正、瀧 和夫、立本英機、松島 眸、本田善則：環境因子としての底質処理が生態系群集構造に及ぼす影響、環境情報科学論文集、16巻、pp.257-262 (2002.11.)
46) N.Hayashi, K.Murakami, N.Fujimoto, M.Mizuochi, Y.Inamori：Effect of Environmental Factors on Growth Characteristics of The Ciliate Protozoan Colpidium campylum, National History Research, Vol.7, No.2, pp.203-210 (2003.3.)
47) M.Mori, H.Matsushima, K.Tanaka, K.Murakami, K.Taki, N.Hayashi：Filtering and Respiratory Properties of a Bivalve of Mashijimi (fresh water Corbicula leana) in Lake Tega, Proceedings of IAGLR/ILEC Joint Conference, CD-ROM (2003.5.)
48) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：海浜公園池におけるエコサイクルに着目した生態系修復技術の検討、土木学会海洋開発論文集、19巻、pp.415-420 (2003.7.)
49) K.Murakami, T.Ishii, K.Taki, Y.Ishii, H.Tatsumoto：Material Circulation and Species Composition in Tidal Flat Microcosm System, Proceedings of 6th International Conference on the Mediterranean Coastal Environment (MEDCOAST'03), Vol.2, pp.825-830 (2003.10.)
50) 村上和仁、瀧 和夫、松島 眸：富栄養化湖沼における植物プランクトン優占種の遷移機構−優占種の遷移に及ぼす温度および照度の影響に関する実験的検討−、環境情報科学論文集、17巻、pp.331-334 (2003.11.)
51) 林 紀男、村上和仁、藤本尚志、稲森悠平：二枚貝マシジミの濾水速度に及ぼす環境因子の影響、千葉生物誌、53巻、1･2号合併号（通巻112号）、pp.5-12 (2004.1.)
52) 矢内栄二、早見友基、五明美智男、村上和仁、瀧 和夫、石井裕一：現地観測に基づく春季の谷津干潟におけるアオサの流入特性、土木学会海洋開発論文集、20巻、pp.341-346 (2004.7.)
53) K.Misono, N.Kitamura, H.Matsushima, K.Tanaka, S.Moriyama, K.Murakami, K.Taki, N.Hayashi, T.Mutoh：Detoxification of Microcystin using the Filter-feeder Function of Corbicula leana in Fresh Water, Proceedings of IAGLR'05, CD-ROM (2005.5.)
54) K.Taki, K.Murakami, S.Mononobe, K.Kato：Characteristics on Spring Hybrid Filter System for Particle Separation applied to Lake Water, Proceedings of IWA International Conference on Particle Separation, pp.607-612 (2005.6.)
55) G.Konishi, H.Matsushima, K.Tanaka, K.Murakami, K.Taki, N.Hayashi, T.Mutoh：Filter-feeding Function and Respiratory Properties of a Fresh Water Corbicula leana, a Native Bibalve called Mashijimi in Lake Tega Basin Area in Japan, Proceedings of 11th International Conference on the Conservation and Management of Lakes (ILEC 2005), CD-ROM (2005.10.)
56) K.Murakami, T.Ishii, K.Taki, H.Matsushima：Seasonal Changes of Phytoplankton in Seaside Park Pond on Kujyukurihama Coastal Line, Japan, Proceedings of 7th International Conference on the Mediterranean Coastal Environment (MEDCOAST'05), Vol.1, pp.581-590 (2005.10.)
57) 村上和仁、田中崇大、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：野外実験生態系におけるプランクトン群集の遷移に及ぼす各種水質浄化手法の影響、環境情報科学論文集、19巻、pp.309-314 (2005.11.)
58）村上和仁、瀧 和夫、物部長順、加藤耕一：バネフィルターろ過法による有害微生物の除去、2006年日中水道技術国際シンポジウム論文集、pp.12-15 (2006.11.)
59) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：富栄養化湖沼における季節変遷を考慮した底泥処理の検討、環境情報科学論文集、20巻、pp.37-42 (2006.11.)
60) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：海浜公園池における水の華発生機構と環境要因、土木学会海洋開発論文集、23巻、pp.627-632 (2007.7.)
61) K.Murakami, T.Ishii, K.Taki, H.Matsushima：Waterplant Purification in Experimental Mesocosm System with Long-term Observation, Proceedings of 2nd IWA-ASPIRE Conference and Exhibition, CD-ROM (2007.10.)
62) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：底泥処理における環境修復強度の生物多様性に及ぼす影響、環境情報科学論文集、21巻、pp.75-80 (2007.11.)
63) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫：海浜公園池（汽水湖）における水の華と栄養塩負荷特性、土木学会海洋開発論文集、24巻、pp.633-638 (2008.7.)
64) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫、松島 眸：底泥処理による湖沼内部生産の抑制効果、環境情報科学論文集、22巻、pp.487-492 (2008.11.)
65) 村上和仁：バイオレメディエーションにおける導入有用細菌の遺伝子伝播と生物間相互作用、土木学会海洋開発論文集、25巻、pp.485-490 (2009.7.)
66) K.Murakami：Fundamental Studies for Bioremediation; Horizontal Transfer of Plasmid DNA in Aquatic Model Ecosystems including Microbial Interactions, Proceedings of 3rd IWA-ASPIRE Conference and Exhibition, CD-ROM (2009.10.)
67) 村上和仁、石井俊夫、瀧 和夫：強閉鎖性で浅い海浜公園池における底泥の天日干しによる水質の揺り戻し現象、環境情報科学論文集、23巻、pp.435-440 (2009.11.)
論文（査読なし）（11件）
1) 村上和仁、鷹野 洋、荻野泰夫、森 忠繁：児島湖の汚濁の現状と水質浄化対策、用水と廃水、38巻、6号、pp.445-450 (1996.6.)
2) 村上和仁、鷹野 洋、荻野泰夫、和田 洋、守安秀徳、赤木興二：鳴滝ダムにおける流入負荷と発生源の検討、全国公害研会誌、23巻、1号、pp.27-34 (1998.4.)
3) 村上和仁、吉岡敏行、鷹野 洋、荻野泰夫：植物プランクトンを指標とした児島湖流域の水質評価、全国公害研会誌、23巻、2号、pp.94-100 (1998.7.)
4) 村上和仁、吉岡敏行、荻野泰夫、森 忠繁：児島湖流域に発生した淡水赤潮、用水と廃水、40巻、12号、pp.1053-1059 (1998.12.)
5) 村上和仁、鷹野 洋、吉岡敏行、荻野泰夫：CODおよび栄養塩類からみた児島湖の水質特性の解析、全国公害研会誌、23巻、4号、pp.231-239 (1999.1.)
6) 小山武信、永淵 修、村上和仁、清木 徹、駒井幸雄、東 義仁、今富幸也、牛川 務、日野康良、高松公子、蠣灰谷喬：瀬戸内海の底質汚染および水質汚濁の現況について、全国公害研会誌、24巻、1号、pp.37-56 (1999.4.)
7) 稲森悠平、村上和仁：環境指標としてのバイオアッセイ、化学工業、50巻、9号、pp.657-667 (1999.9.)
8) K.Taki, K.Murakami, S.Kogai, H.Matsushima, S.Mononobe, K.Kato：Development and Application of Spring Hybrid Filter System to Wastewater Treatment, Proceedings of Japan-China International Symposium on Membrane Hybrid System applied to Water Treatment, pp.130-136 (1999.10.)
9) N.Hayashi, K.Murakami, Y.Inamori：A Case of Active Civil Participation in Environmental Conservation in the Basin of Tega marsh, Proceedings of Japan-China International Symposium on Membrane Hybrid System applied to Water Treatment, pp.279-285 (1999.10.)
10) K.Murakami, Y.Ogino, T.Mori：Environmental Education by Biological Monitoring in Lake Kojima, Proceedings of Japan-China International Symposium on Membrane Hybrid System applied to Water Treatment, pp.286-291 (1999.10.)
11) 稲森悠平、村上和仁：マイクロコズムを用いた外来微生物導入の安全性評価、環境技術、30巻、6号、pp.426-434 (2001.6.)